Travailler sur des représentation 3D des molécules de l'immunité

Il existe de nombreux logiciels qui permettent une visualisation de molécules biologiques.
Le logiciel RasMol, très répandu, est de par sa simplicité d'utilisation, bien adapté à l'enseignement.

Il permet

* de visualiser des biomolécules en choisissant un mode de représentation pertinent,
* de manipuler facilement les molécules : orientations 3D permettant une appréhension de la configuration spatiale, codage adapté des couleurs, visualisation des différents composants ...
* d'explorer sa configuration : liaisons, atomes, groupements, chaînes, structures particulières ...

Deux exemples d'utilisation pédagogique :

la double reconnaissance RCT-HLA
la compléméntarité Ig/Fab-Ag

 

Le site de l'INRP permet de télécharger une version française, pour PC, du logiciel RasMol avec une base de données moléculaires adaptée à nos programmes d'enseignement : http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo
La Protein data bank
regroupe une énorme banque de données biomoléculaires, utilisables avec RasMol. On pourra y trouver d'innombrables molécules immunitaires. Il est également possible d'y télécharger différentes versions du logiciel.  
http://pdb.pdb.bnl.gov/
Bibliographie : Structure et fonction des molécules biologiques, Barrère, Dupont, Salamé, INRP

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